Depuis sa création, les médecins qui font partie de l’AEMV, se sont rendus annuellement dans une série de pays dépourvus de soins spécialisés. Ces missions ont permis d’opérer des dizaines d’enfants souffrant principalement de malformations congénitales et de séquelles de brûlure et de noma. Du matériel médical a été acheminé et parfois laissé en donation aux centres qui ont accueilli ces missions. La plupart des missions chirurgicales ont été organisées et financées en collaboration avec l’organisation Sentinelles et ses maisons d’accueil au Niger et au Burkina Faso. Les rapports des missions sont disponibles sur la page Actualité.
La collaboration avec les soignants locaux est de règle, de même que le suivi à long terme des patients opérés.
Une vidéo illustre la mission chirurgicale en 2016 à Ouadougou. Pour avoir une idée voir la bande annonce de cette vidéo.